Ну вроде ясно, что если по каким запросам программа не показывает позиции, то стало быть по этим запросам сайт ниже цифры, выставленной в настройках Стандартный интерфейс - глубина проверки.
Но стал снимать позиции через Яндекс.XML и возник вопрос.
При проверке через Яндекс.XML глубина проверки наследуется ли от "Стандартный интерфейс"?